Daenerys Targaryen (joka tunnetaan myös nimillä Daenerys Myrskyntytty, Khaleesi, Lohikoirien Äiti ja Ketjujen Murtaja) on yksi George R. R. Martinin romaanisarjan A Song of Ice and Fire ja HBO:n Game of Thrones -sovitelman päähenkilöistä. Häntä esittää Emilia Clarke (alkuperäisessä, ei lähetetyssä vuoden 2009 pilottijaksossa roolissa oli Tamzin Merchant). Daenerys on kuningas Aerys II Targaryenin ("Törkeä kuningas") ja kuningatar Rhaella Targaryenin tytär sekä prinssi Rhaegar ja prinssi Viserys Targaryenin sisar.

Matkansa aloittaessaan maanpaossa asuvana prinsessana Essoksessa, Daenerys myydään avioliittoon dothrakilaissotaherran Khal Drogon kanssa hänen pyrkivänsä veljensä Viserysin toimesta. Drogon kuoleman jälkeen hän asettaa kolme kiveksiä muuttunutta lohikäärmemunaa hautapalopöydälleen ja astuu liekkeihin. Hän selviää palamattomana yhdessä kolmen juuri kuoriutuneen lohikäärmeen kanssa: Drogon, Rhaegal ja Viserion.

Hän rakentaa tämän jälkeen voimakkaan sotilasvalloitusretken Orjakaupungit-nimellä tunnetulle alueelle – ostaa Unsullied-armeijan Astaporista, vapauttaa Yunkain ja valloittaa Meereenin lopettaakseen orjuuden – ohjattuna neuvonantajinaan Jorah Mormont, Missandei, Grey Worm, Barristan Selmy ja Tyrion Lannister. Hänen lopullinen tavoitteensa on hyökätä Westerosiin ja vaatia Rautatronia. Hän liittyy ja alkaa romanttisen suhteen Jon Snow'n kanssa (joka on salassa hänen velipoikansa Aegon Targaryen), ja Daenerys auttaa Suuressa sodassa kuolleita vastaan ennen kuin kääntää lohikäärmeensä King's Landingiä vastaan. Hänen valloitusretkensä päättyy tragediaan pääkaupungin tuhoutumisen jälkeen, ja hän kuolee Jon Snow'n käsiin.